万行法师的佛学思想随着与社会实践的结合，逐步形成了他个人的基本理念；至今，万行法师已相继出版了数部佛学修行类专著，包括2004年国家宗教出版社出版的《心中月》，2007年华夏出版社出版的《降伏其心》，2010年12月出版的《善用其心》， 2011年出版的《其心无往》以及2014年出版的《微言大义》。
《降伏其心》是万行法师自2001至2003年开山建寺期间的开示录，书中主旨在于“降心“。该书如其名，像一把金刚宝剑，劈开我们人性中贪嗔痴的一面，进而点亮我们人性中戒定慧的另一面。到最后让我们明白“历世炼心即是福慧双修”、“大智无非善护念”、“自我反省就是修道”、“守住真心胜过所有法门”。
人的一生就是一个修炼的过程，从青少年时期学会如何充实自己的身口意，如何管住自己的身口意，如何降伏自己的身口意。
《善用其心》是继《降伏其心》之后，万行法师在建寺安僧期间针对四众弟子在信佛学佛、参禅打坐、为人处事等方面提出的问题所讲的开示。是“降心”之后必经的“用心”阶段，让我们从“随境能出入，方为自在人”、“万千法门不离觉照”、“提起是为了放下”、“心灵是万物的总开关”、“终点就是起点”的般若中明白“世事洞明皆学问，人情练达即文章”。
青壮年时期学会如何善用自己的身口意，如何广结善缘，如何培植自己的福慧，如何为人类、为社会多做贡献。
《其心无住》是《善用其心》的另一进阶，是万行法师在出关后十余年中从开山建寺到安僧讲法以及三十余年来修学佛法的总结。我们能从那“行藏有道，顺其自然”、“活在当下，用在当下”、“一心不乱就是禅”、“人天合一即是道”中领略“自然是道”、“大道至简”，进而明白“一切境界皆是沿途风光”的“无住”般若。
《心灯》是万行法师继“三心一月言大义”之后的最新力作，层次更高、视野更宽、角度更全，涵盖了我们在世出世上遇到的各种人生问题。让我们彻底了悟在历经了降心、用心、心无住之后，发现吾心本自在，三心本无差别。
《心灯》里的每一篇开示犹如一盏心灯，句句都是万行法师真切的心声，都是万行法师对弟子与信徒们情真意切的叮咛，警策与鼓励，希望帮助他们破除心中的无名晦暗，打开缠缚的心结，去掉烦恼障碍，开启心性的智慧与光明，让他们感受到内心的宁静与喜悦，看到人生的希望与美好，从而走上自在的解脱之道。倘若本书对您的修行与人生能有所助益，万行法师则深感幸甚与宽慰 。人到中老年发现人生的苦恼皆是对往事的执念，人生需要把握的事物只有百分之十，而百分之九十的事物是取决于我们对事物的看法，是取决于我们的观念。
万行法师：“其心大而无外，小而无内。大时包太虚，小时不容针。成事由其心，败事亦由心。其心被动为奴隶，其心主动成主人。其心不降是懦夫。降之不善用为愚夫。事过执著留恋乃凡夫。其心降伏，善用且无住，则圣人成矣。其心虽三，实为一体。欲用，先降。过后有痕，非真降，非真用。真降，真用，则无痕。”三心讲十年，悟则刹那间。降心是为用，用了若无住，吾心本自在。
心若无物，何来烦恼；如何无物，心灯不灭；蓦然回首，我本自在。降心，用心，心无住，心岂不自在乎！
